生物基因类论文参考文献大全
1.【期刊论文】医药领域生物基因工程的应用探究
期刊:生物过程
摘要:生物基因工程是一种基于人工手段对生物体的基因进行改造和重组,以改变生物体遗传特性和基因功能的技术。这项技术应用于医药领域,已在生物制药、疫苗开发、基因检测和基因疗法方面发挥作用,体现出其在批量制备生物活性药品、开发更安全的基因疫苗、检测患者基因型并定制个性诊疗方案或判断疾病发展趋势、靶向治疗遗传疾病等领域的应用优势。Biological genetic engineering is a technology based on artificial means to modify and recombine the genes of organisms to change the genetic characteristics and gene functions of organisms. This technology has been applied in the field of medicine, and has played a role in biopharmaceutical, vaccine development, gene testing and gene therapy, reflecting its application advantages in the field of batch preparation of bioactive drugs, development of safer genetic vaccines, detection of patients’ genotypes and customized diagnosis and treatment plans or disease development trends, and targeted treatment of genetic diseases.
关键词:医药领域;生物基因工程;DNA
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2.【期刊论文】一种面向生物基因多序列比对算法的任务调度方法
期刊:计算机与现代化
摘要:针对现阶段生物基因多序列比对算法在面对大规模数据时存在比对效率慢的问题,提出一种面向生物基因多序列比对算法的任务调度方法,以提高生物基因多序列比对的效率。通过Trie树方法对生物基因多序列数据展开分割处理,从而提高后续基因多序列比对过程中数据查找和匹配的效率;构建基因多序列BWT索引,利用BWT索引方法完成生物基因多序列比对;以多序列比对方法为基础,采用CPU与GPU异构并行系统完成多序列比对的任务调度。实验结果表明,所提的面向生物基因多序列比对算法的任务调度方法效率更高、性能更好,且更适合于实际应用。
关键词:生物基因;任务调度;多序列比对;CPU与GPU;BWT索引方法
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3.【期刊论文】最完整海洋微生物基因数据库出炉
期刊:水产科技情报
摘要:近日,记者从“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会上获悉,华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学等机构,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现大量具有应用潜力的基因资源。该研究为开发抗菌肽、新型基因编辑工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相关成果在线发表于国际学术期刊《自然》上。
关键词:国际学术期刊;基因数据库;海洋微生物;生命科学;新型基因;基因资源;基因测序;基因库
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4.【期刊论文】高质量临床微生物基因组参考数据库构建的思考
期刊:中国食品药品监管
摘要:病原宏基因组高通量测序(mNGS)技术因其检测时间短、分辨率高,能识别罕见、新发病原体引发的感染或者混合感染等优势,已经被广泛地应用于临床疑难感染的辅助诊断。然而,由于目前尚缺乏标准化生物信息学分析流程和高质量临床微生物基因组参考数据库等问题,一定程度上制约了该技术临床应用的进一步发展。本文介绍了高质量临床微生物基因组参考数据库建设现状,探讨了高质量临床微生物基因组参考数据库构建的技术要求、质量控制过程和实现方式,并提出相关思考和建议。
关键词:病原宏基因组高通量测序;生物信息学分析;微生物基因组参考数据库;建设现状;技术要求
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5.【期刊论文】促生菌种组合提高玉米根际土壤有益微生物基因丰度及促生效应研究
期刊:植物营养与肥料学报
摘要:【目的】微生物肥料一般需要采用复合菌种提高有益菌在作物根际的定殖和促生效果。我们对本实验室前期分离鉴定的26个具有不同功能的玉米根际菌株进行复配,并研究复合菌株在土壤中的有益作用及其促生效果。【方法】按照功能共构建了4组合成菌群:C1,将铁载体分泌量最高的解磷菌、解钾菌、自生固氮菌、联合固氮菌各1株进行组合;C2,将吲哚乙酸(IAA)分泌量最高的解磷菌、解钾菌、自生固氮菌、联合固氮菌各1株进行组合;C3,每个菌属选择1株综合促生能力最强的菌株进行组合;C4,由C1与C2所有菌株组合。用以上4组菌群在灭菌土壤和未灭菌土壤上分别进行玉米接种菌剂和土壤浇灌菌剂盆栽试验,包括无菌剂对照在内共10个处理,灭菌土壤处理分别记为MCK、MC1、MC2、MC3、MC4,未灭菌土壤处理分别记为WCK、WC1、WC2、WC3和WC4。玉米接菌试验是将初生胚根长1~2 cm的玉米种子浸泡在菌群悬浮液中1 h,然后种植在灭菌土壤和未灭菌土壤中,9天后测定株高、鲜重、根长、根尖数和分叉数。土壤浇灌试验采用种子发芽方法,将种子播在灭菌和未灭菌土壤中,每5天浇灌1次菌悬液,待玉米生长15天后,收集玉米根际土壤用于宏基因组学测序,揭示菌群对玉米根际微生物的影响及其促生机制。【结果】4个复合菌剂相比,C4表现出最好的综合促生能力。玉米接种C4后,幼苗株高、地上鲜重、根鲜重、根长、根尖数和分叉数在灭菌组中分别比对照提高了28.97%、46.00%、59.99%、61.99%、62.27%和46.70%,在未灭菌组中分别提高了27.49%、25.86%、50.13%、40.11%、62.26%和82.55%。复合菌群C4提高了根际土壤中有益菌属Pseudomonas、Klebsiella、Duganella、Cellvibrio、Pantoea、Pseudoxanthomonas的丰度,在浇灌菌群C4的玉米根际土壤中,有益菌属Enterobacter和Klebsiella的注释丰度与对照组相比显著提高。菌群C4提高了根际土壤中磷和氮的转运、IAA的合成、铁载体的转运与调控系统和碳循环相关的功能基因的丰度,部分丰度上升的功能基因的微生物溯源分析结果显示,多数有益微生物的菌属丰度与功能基因丰度呈正相关,同时在ugqB、phnW的基因集中注释到了菌群C4的成员Klebsiella。【结论】菌群C4改变了玉米根际细菌群落组成,提高了有益菌属丰度,富集了促生相关功能基因,具备微生物复合菌肥开发的潜能。
关键词:生物肥料;促生机制;植物根际促生菌;合成菌群;玉米
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6.【期刊论文】基于Spark云计算的生物基因多序列比对方法
期刊:计算机测量与控制
摘要:在生物基因多序列比对过程中,早期的方法仅计算了单一的Spark集群参数,导致算法的并行效果较差;为此,设计了基于Spark云计算的生物基因多序列比对方法;基于获得的生物遗传序列数据,对其进行了优化,并通过计算不同序列间的匹配度,对生物基因多序列比对任务进行动态规划;利用Spark云计算技术,构建Spark集群,并对多个Spark集群的参数进行计算;利用多种生物基因序列之间的相似性与差异性来选择最佳的匹配路径,在此基础上,建立多个生物基因序列比对的并行计算模型,并对其进行求解,得到对应的多个序列对比对的并行算法;实验结果表明:该方法具有更好的并行性,能够有效提高多序列比对的性能。
关键词:Spark云计算;生物基因;生物信息学;基因多序列比对;并行算法
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7.【期刊论文】人体肠道微生物基因组DNA提取方法的比较
期刊:当代化工
摘要:探究了不同DNA提取方法对人体肠道微生物菌群研究的影响,为今后研究人体肠道微生物时选择提取方法提供参考依据。选择市面上3种商业化肠道微生物DNA提取试剂盒和1种实验室改良方法对20份人类粪便样本中微生物DNA进行提取,根据DNA浓度、纯度和微生物多样性比较4种DNA提取方法差异。结果表明:Q-试剂盒法(QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit,Qiagen)、ET-试剂盒法(ET粪便DNA快速提取试剂盒,IDMBIO)、P-实验室改良法3种方法提取的DNA得率较高;方法 P获得的OTU数量最多;α多样性分析结果显示4种提取方法差异不显著;方法 P、方法 Q得到肠道微生物组成结构相似度较高,方法 ET、方法 Y(MolPure Stool DNA Kit,Yeasen)得到肠道微生物组成相似度较高;4种DNA提取方法所得微生物群落构成在门水平和属水平差异明显。每种DNA提取方法都有各自提取偏好性菌属,经过综合比较,方法 Q和方法 ET提取DNA的得率更高、速度更快。
关键词:DNA提取;高通量测序;扩增子测序;微生物群落
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8.【期刊论文】电活性微生物基因编辑与转录调控技术的应用
期刊:工业微生物
摘要:电活性微生物能够通过代谢过程直接与电极进行电子交换,在可持续能源生产和环境污染治理方面具有潜力。基因编辑和转录调控技术的不断发展,对电活性微生物的性能产生了影响,进一步推动了电子转移效率、生物能源产量和污染物处理能力的提高。因此,文章旨在探讨电活性微生物基因编辑与转录调控技术的应用,以期为更好地利用电活性微生物提供理论参考。
关键词:电活性微生物;基因编辑;转录调控技术
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9.【期刊论文】索元生物基因疗法DB107临床2期试验获FDA批准
期刊:首都食品与医药
摘要:近日,美国食品药品监督管理局(FDA)批准索元生物基因疗法DB107的临床2期试验。该临床试验由全球脑瘤领域知名研究机构:加州大学旧金山分校(UCSF)、加州大学圣迭戈分校(UCSD)以及南加州大学(USC)的研究者共同发起,将验证全新生物标志物DGM7作为预测性生物标志物指导下,DB107治疗高级别神经胶质瘤(HGG)的有效性。
关键词:基因疗法;南加州大学;神经胶质瘤;临床试验;圣迭戈;生物标志物;旧金山分校
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10.【期刊论文】微生物基因检测技术在鄂尔多斯盆地神府南气田勘探中的应用
期刊:中国煤层气
摘要:针对鄂尔多斯盆地构造复杂,储层分布差异大,气藏富集规律不明等问题,本文采用微生物基因检测技术的荧光定量PCR法测量研究区样品中油气指示基因的丰度,同时利用高通量基因测序法检测样品中的烃类微生物种群类型,分析认为,本区主要有东北部、西部、南部三个烃类异常带,展布特征与沉积认识吻合,且西部、南部有亲缘关系,东北部与二者无亲缘关系,可能与致密气、煤层气不同层系烃的逸散有关。实钻表明,本技术对于鄂尔多斯盆地致密气和煤层气混源区的含油气性评价方面具有较好的适用性,为油气有利区带筛选提供参考依据。
关键词:鄂尔多斯盆地;黄土塬地貌区;微生物基因检测;荧光定量检测;高通量基因测序
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